京城突然爆发瘟疫，百姓死伤无数，程村霞(张皓然 饰)带领太医们抗击瘟疫，但因为汪国公(张柏俊 饰)和曹吉祥(卢森堡 饰)的私心而遭遇阻挠，瘟疫蔓延得很快。祁钰生怕染上瘟疫，带着家眷逃到宫中的湖心小岛。祁钰派人接允贤，汪美麟(金晨 饰)暗中买通了下人故意把船弄沉，要淹死允贤，幸好允贤及时察觉，逃出了宫。允贤在宫外和程村霞一起治疗民众的瘟疫，发现这种奇怪的瘟疫和她听瓦剌蒙医提到的一种黑死病很像，便根据蒙医教授给她的方法给病人们治疗。危急时刻，英宗也趁乱跑了出来，帮助允贤一起抗击瘟疫。允贤的方法起到效果，原本混乱的局面得到了控制，英宗和允贤得到了百姓和众臣的爱戴。祁钰得知允贤和英宗在抗击瘟疫的过程中关系亲密，又要囚禁英宗，允贤奋力阻拦，突感身体不适，程村霞检查后发现允贤已经怀孕。